계통발생학은 생물의 진화적 역사와 친연관계를 추정해 계통수로 재구성하는 학문이다.[1] 겉모습의 유사성만 보는 계통분류학과 달리, 형태 형질과 유전자 서열을 함께 다루며 분자진화학·분자계통학과 긴밀하게 연결된다.[1]
1. 개요
2. 연구 방법
계통발생학 연구는 크게 형태 자료와 분자 자료를 함께 읽는 방식으로 진행된다. 표본의 외형, 골격, 생식 구조 같은 형질은 계통분류학의 오랜 기반이었고, 오늘날에는 염기서열 비교와 정렬, 모형 선택, 계통수 추론이 결합된다. 이렇게 얻은 결과는 생물학 전반의 비교 연구에 다시 쓰인다.[1]
분자 자료만으로 모든 문제가 해결되지는 않으므로, 서로 다른 데이터셋을 합치는 방법도 중요하다. 이때 여러 연구에서 얻은 계통을 통합하는 분자계통학적 접근이나 supertree 방식이 사용되며, 대규모 분류군을 다룰 때는 자료의 편향을 줄이기 위한 설계가 필요하다.[4]